1、传导原理不同

　　光学内窥镜内部结构为物理光学系统，目镜由光学透镜、镜管内部由柱状光学透镜、或半软/软性光学纤维，以光学的物理原理组成。整条光学内窥镜传导的是光。

　　电子内窥镜内部结构为电路系统，目镜为微型摄像头芯片，镜管内部为信号电线，通过目镜摄像头芯片采集图像信号，信号通过镜管电线传递，从镜子尾端传出到摄像主机。整条电子内窥镜传导的是电信号。

　　2、组成结构不同

　　光学内窥镜由光学成像系统和照明系统组成。光学成像系统由物镜、转像系统、目镜系统三大系统组成，照明系统为光学纤维束。被观察物经物镜所成的图像，通过转像系统传输到目镜，再由目镜或者目镜外接摄像系统放大用于观察。照明部分采用冷光源用光导纤维的方法，为了传送清晰图像, 有效不锈钢插入部分内设计为若干光学元件的转像透镜系统，将内部的物象通过光的传输，没有失真的传到检测者的眼睛，所以光学内窥镜成像非常的保真，清晰度最高的。

　　光学内窥镜包含：光学硬管镜，光学半硬镜，光学软镜。

　　电子内窥镜不通过光学镜头导像，也不通过光纤传像，而是通过内窥镜前端的电荷耦合元件(CCD)或者互补金属氧化物半导体(CMOS)作为图像传感器，将光信号转变为电信号，再经由图像处理器处理后在监视器上获取出色彩真实、高清晰的画面。电子内窥镜的外径更细，图像显示清晰度高，照明亮度强。电子内窥镜系统主要由光源、图像处理器、监视器、电子内镜及附件组成。电子内窥镜在监视器上进行图像显示，特点在于亮度高、寿命长，探头可弯曲，能够任意改变观测方向，图像清晰，便于观察，方便图像数据的保存和后期处理。

　　电子内窥镜包含：电子硬镜，电子软镜。

　　3、应用不同

　　医用光学硬镜主要包括：

　　口腔科：牙内窥镜

　　耳鼻喉颈科：耳镜、鼻窦镜、喉镜、甲状腺镜

　　神经科：脑室镜、神经内镜

　　消化科：食道镜、直肠镜

　　外科：腹腔镜、胸腔镜、纵膈镜、胆道镜

　　泌尿科：膀胱镜、电切镜、经皮肾镜

　　妇科：宫腔镜

　　骨科：关节镜、椎间孔镜、椎间盘镜

　　其他：3D内窥镜

　　医用电子内窥镜主要包括：

　　消化科：电子食道镜、超声电子食道镜、电子胃镜、超声电子胃镜、电子肠镜（十二指肠、小肠、结肠）

　　呼吸科：电子鼻咽镜、电子支气管镜

　　外科：电子腹腔镜、电子胆道镜

　　泌尿科：电子输尿管镜

　　其他：胶囊内窥镜、3D电子镜