从化学角度讲，这是因为碱基之间的氢键互配。

　　从生物学角度讲，这是为了在复制中保持遗传信息的稳定性。

　　因为在DNA分子中，DNA链是有顺序的，也就是形成链的2个相邻碱基之间的磷酸二脂键是有成键的顺序。

　　具体来说。是碱基的脱氧核糖上的5`位的C的磷酸酯的羟基氧，再与另外一个碱基的脱氧核糖的3`位的C原子形成酯键。

　　简单说，就是磷酸二脂键只能是3` -5` 的顺序，对应于一条DNA链，也必须依照这个顺序。

　　

　　如果一条DNA连的顺序是3`GTCA5`，那么另外一条就是只能是5`CAGT3`与之互补。

　　这是从单条链的内部看。

　　从两条链之间看，两条链内侧的碱基通过氢键配对连接，比如一条是GTCA，另一条一定是CAGT，这样才能在两条链之间形成互相配对的氢键，双螺旋链才能稳定存在。

　　这是从化学角度看。

　　从生物学角度看，DNA复制是半保留复制，是以最开始的双链分子中的一条作为模板进行DNA复制，产生两个完全一致的DNA分子，每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链。

　　DNA上的遗传信息只存在于其中一条链上，遗传信息从DNA流向RNA，即双链DNA在转录成单链mRNA时，只有一条链起模板作用，这条链称为意义链，另一条链为反意义链。

　　比如意义链中某段碱基排列为GTCA，在DNA复制时，依照碱基配对原则，新链的这几个碱基就只能是CAGT，为反意义链。

　　而在另一条反意义链上，此段碱基为CAGT，以此为模板的新链中，就成了GTCA，为意义链。

　　这样一来，在新合成的两个子代DNA双螺旋链中，也都有一条是意义链，另一条是反意义链，它们的碱基排列顺序完全一致，保持了遗传的稳定性。

　　就是说一条的序列跟另一条的一定是倒过来的，不管是从3` -5` 的顺序看，还是从碱基排列顺序看都是如此，也不管这条DNA有多长。